Pour les bouteilles et les cartons de jus entamés, les fabricants n'indiquent souvent qu'une durée de stockage de deux à cinq jours. Si ces produits sont bien réfrigérés et ne sont pas contaminés, ils se conservent généralement plus longtemps. Il ne faut en aucun cas boire directement à partir de l'emballage ou de la bouteille afin d'éviter la fermentation des jus. Il est préférable de refermer le produit entamé immédiatement après l'avoir versé et de le remettre rapidement au réfrigérateur. Le jus peut ainsi être consommé jusqu'à 14 jours. Les jus acides se conservent plus longtemps que les jus sucrés. Dans une bouteille en verre, il est plus facile de détecter les bulles, les troubles et les moisissures. Il est donc préférable de transvaser les jus en carton dans des bouteilles en verre qui se ferment bien. Un dépôt trouble dans un jus clair (ou inversement un dépôt clair dans un jus trouble) indique un début de décomposition du jus.